扬州大学医疗卫生中心座落在风景优美、学术氛围浓厚的扬州大学校园内，担负着扬州大学4万余名师生员工的医疗、预防保健、健康教育、急救、传染病预防和管理、公共卫生突发事件的应急处理、公共场所的卫生监督、各类新进人员的健康体检、慢性非传染性疾病的干预等任务，是在扬州市卫生局登记注册的非营利性医疗机构，编制床位16张。

　　医疗卫生中心全部建筑面积2097平方米，医疗设备总值2百多万元，其中有日本奥林巴斯全自动生化分析仪、日本东芝SS-550A彩超机、东方500型F51-8C X光机、德国euroklav23V-S调温灭菌器等一批先进设备。临床科室以全科医学为主，另设有口腔专科、中医等科室，医技辅助科室有心电图、放射、B超、检验等。

　　医疗卫生中心下设5个卫生所，分布在不同校区，年门、急诊量13万余人次，各类体检2.5万人次，预防接种1.2万人次。现有在编职工56人，返聘、外聘3人，其中有卫生系列专业技术职称的52人，占93%。具有高级职称者7人，中级职称35人（主治医师18人、主管护师16人、主管药师1人），初级职称10人（医师2人、护师6人、药师2人），学历结构中，医学硕士1名，学士8名。

　　2005年以来，医疗卫生中心进一步优化了布局和流程，自行开发了医疗卫生管理软件，增设了电子触摸屏等导医服务，公共医疗场所全部安装了空调、彩电等，诊疗条件大大改善。为方便师生就诊，校医疗卫生中心还聘请了三级医院的医学专家，分15个诊疗科室开设了医学专家门诊（心血管、消化、神经内科、骨科、B超等）；利用扬州市口腔专科医院的医疗力量，常年在校内开展口腔专科服务。医疗卫生中心始终坚持以人为本、服务第一和预防为主的理念，不断提高医务人员的素质，以追求师生满意为目标，不断强化医务人员服务意识，急病人所急、想病人所想，把师生的利益放在第一位，在全体医务人员的共同努力下，医疗卫生中心近年来连续被扬州市卫生局评为“先进单位”。